平卧菊三七属森林蔬菜或是药源性植物，对土壤理化性质、杀虫剂的使用、肥料的使用等方面要求比较高，所以对于这些病虫害要求通过物理防治为主辅以少量植源性生物杀虫剂。

平卧菊三七的病害主要有茎腐病、立枯病、根腐病、黑斑病等；虫害主要有金针虫（Pleonomus canaliculatus）、粉蝶灯蛾（Nyctemera plagifera Walker）、斜纹夜蛾（Prodenia litura Fabricius）、路瑙夜蛾（Maliattha vialis Moore）和黄刺蛾（Cnidocampa  flavescens Walker）等。